Équipe évoluant dans la Ligue de hockey junior majeur du Québec (LHJMQ) depuis 1997-1998.
Première équipe de hockey junior majeur implantée sur la Côte Nord, le Drakkar de Baie-Comeau s'est qualifié pour les séries éliminatoires dès sa troisième saison.
Le Drakkar a connu sa meilleure campagne en 2002-2003 alors qu'il a remporté le trophée Jean-Rougeau à titre de champion du calendrier régulier avec une excellente récolte de 108 points et 50 victoires. Cette année-là, le Drakkar s'est incliné en demi-finales contre le Mooseheads de Halifax.
Au terme de la saison 2007-2008, le Drakkar de Baie-Comeau présentait un dossier cumulatif de 350 victoires, 347 défaites, 49 matchs nuls, 20 défaites en prolongation et 12 défaites en fusillade.
Quelques anciens joueurs des Huskies sont ensuite passés à la Ligue nationale de hockey, entre autres Marc-André Bergeron, Yanick Lehoux, Bruno Saint-Jacques, Joël Perrault, Patrick Thoresen et Jean-François Jacques.
DOSSIER DU DRAKKAR DE BAIE-COMEAU DANS LA LHJMQ
| Saison | PJ | V | D | N | DP | BP | BC | Pts | Éliminatoires | |
| 1997-1998 | 70 | 17 | 48 | 5 | 214 | 332 | 39 | Hors des séries | ||
| 1998-1999 | 70 | 18 | 44 | 8 | 208 | 297 | 44 | Hors des séries | ||
| 1999-2000 | 72 | 31 | 31 | 5 | 5 | 257 | 285 | 72 | Huitièmes de finale | |
| 2000-2001 | 72 | 41 | 23 | 8 | 0 | 283 | 255 | 90 | Demi-finales | |
| 2001-2002 | 72 | 38 | 25 | 7 | 2 | 288 | 231 | 85 | Huitièmes de finale | |
| 2002-2003 | 72 | 50 | 14 | 6 | 2 | 319 | 213 | 108 | Demi-finales | |
| 2003-2004 | 70 | 21 | 42 | 5 | 2 | 195 | 285 | 49 | Huitièmes de finale | |
| 2004-2005 | 70 | 24 | 37 | 5 | 4 | 208 | 280 | 57 | Huitièmes de finale | |
| PJ | V | D | DP | DF | BP | BC | Pts | |||
| 2005-2006 | 70 | 30 | 38 | 2 | 0 | 249 | 285 | 62 | Huitièmes de finale | |
| 2006-2007 | 70 | 35 | 26 | 1 | 8 | 304 | 285 | 79 | Quarts de finale | |
| 2007-2008 | 70 | 45 | 19 | 2 | 4 | 249 | 210 | 96 | Huitièmes de finale |